5. United-Atom-Näherung

Vor allem für große Biomoleküle hat sich die United-Atom-Näherung etabliert, die z.B. in Lernumgebung verlassen GROMOS implementiert ist.

Wasserstoff wird nicht mehr explizit berücksichtigt, ganze Gruppen werden zusammengefaßt.

So wird z.B. die Methylgruppe als ein Atom mit dem vdW-Radius von 2 Angstrom (zum Vergleich: vdW-Radius von Brom beträgt 1.95 Angstrom) betrachtet. Ähnlich verfährt man mit der Methylengruppe und anderen.