Im nächsten Schritt werden die vier Orbitale des Kohlenstoffs mit den Wasserstoff-Orbitalen gemischt. Dabei entstehen folgende Molekülorbitale der CH3-Gruppe:

spout + 3H Mischen mit den H-Atomorbitalen n (nichtbindend)
spin + 3H Mischen mit den H-Atomorbitalen s + s*
py + 3H Mischen mit den H-Atomorbitalen p + p*
pz + 3H Mischen mit den H-Atomorbitalen p + p*

Um die Molekülorbitale von Ethan (Detail-Info ekliptische Konformation) aufzustellen, bestimmt man die Orbitale, die sich aus der Überlappung zweier CH3-Gruppen ergeben. Dazu muß zunächst die energetische Abfolge der Gruppenorbitale der CH3-Gruppe bekannt sein. Diese ist

s < p < n << p* < s*.