Energiehyperfläche
Trägt man die potentielle Energie eines Moleküls gegen eine Koordinate (z.B. eine Bindungslänge) auf, so erhält man ein Energieprofil. Berücksichtigt man zwei Koordinaten, kann man die  potentielle Energie als Fläche darstellen. Eine Darstellung in Abhängigkeit von drei oder mehr Koordinaten ist anschaulich nicht mehr möglich, man spricht dann von der potentiellen Energiehyperfläche oder Potentialhyperfläche

Ensemble

Ein Ensemble ist eine statistische repräsentative Auswahl von Konformeren aus dem Glossar Konformationsraum.

Konformationsraum

Der Konformationsraum eines Moleküls enthält alle möglichen Konformationen.

Maxwell-Boltzmann-Gleichung

Die Maxwell-Boltzmann-Gleichung gibt die Geschwindigkeitsverteilung für die Teilchen eines Gases in Abhängigkeit von der Temperatur an.
Die Wahrscheinlichkeit, daß ein Teilchen mit der Masse m die Geschwindigkeit v bei der Temperatur T hat, ist:

Maxwell-Boltzmann-Gleichung

Trajektorie

Durch die Trajektorie eines Molekülsystems wird die Konformation (Ortskoordinate und Geschwindigkeit der Atome) als Funktion der Zeit beschrieben.