Alle Summanden, die das Produkt zweier verschiedener Wellenfunktionen enthalten (FiFj), werden aufgrund der Hückel-Näherung (CNDO) nach dem Integrieren gleich Null.
Die Koeffizienten der Summanden mit dem Quadrat einer Wellenfunktion (FiFi) bleiben nach der Integration stehen, da das Quadrat der Wellenfunktionen aufgrund der Normierungbsbedingung gleich Eins wird.
Damit ergibt sich für die Koeffiezienten der Wellenfunktionen zweier verschiedener Hückel-Molekülorbitale:
Das gilt nur für Methoden, die die CNDO-Näherung verwenden.
Als Beispiel sei die Orthogonalität der Wellenfunktionen Y1 und Y2 (n=1, m=2) von Butadien gezeigt.